В 1981 году Воздушные силы самообороны Японии пришли к выводу — Mitsubishi F-1 устарел, и ему требуется замена, которая бы производилась полностью в Японии. Программа началась в 1985 году, и первым делом японцы обратились к американцам, запросив у них возможность разработать свой самолёт на базе F-16 или F/A-18. Программа была обозначена как Mitsubishi FS-X. Японцы брали на себя 60% всех расходов, а американцы — 40%. В качестве основы японские военные выбрали проект увеличенного F-16, ранее отвергнутого американскими ВВС. Но поставили в него свою современную электронику. Сразу планировалось построить два варианта — одноместный F-2A и двухместный F-2B. Первый полёт прототипа состоялся лишь 7 октября 1999 года, а из-за проблем с конструкцией принятие на вооружение затянулось до 2000 года. Последний серийный самолёт из партии в 94 штуки был поставлен 27 сентября 2011 года. В итоге они пошли на замену устаревающим F-4EJ.

Несмотря на внешнюю схожесть с F-16, истребитель имеет ряд отличий: большие размеры и другая внутренняя конструкция, увеличенный хвост, совершенно другая электроника, радар с АФАР, другое остекление, японское вооружение и некоторые другие, менее значительные детали. Пока серийные машины были направлены служить в строевые части, четыре прототипа также были направлены в крыло Air Development and Test Wing (ADTW), ответственное за предэксплуатационные испытания, проверку оборудования JASDF и обучение тактике ведения воздушного боя.

В игру F-2A ADTW был введён в обновлении 2.47 «Левиафаны». Относительно любого F-16, F-2A более манёвренный, но из-за большего крыла быстрее теряет энергию и может проиграть затяжное противостояние один на один. Радуют и отличные тепловые ракеты AAM-3. При этом японец лишён НСЦ, а относительно простого F-2A также лишился УРВВ AAM-4 и ограничен AIM-7M.