Королевство Швеция, стремясь сохранить боеспособность своих ВВС, приступило к очередному этапу модернизации истребителей JAS39 Gripen, ориентированному на устранение ограничений версии C/D и внедрение новых технологий. Ключевым результатом этой программы стала разработка варианта Gripen NG (Next Generation), для отработки которого в 2007 году был создан лётный демонстратор Gripen Demo. Он получил более мощный двигатель General Electric F414G, увеличенную взлётную массу, новое вооружение и авионику, значительно больший запас топлива, а также современную РЛС Raven ES-05 с активной фазированной решёткой (АФАР). Первый полёт состоялся 27 мая 2008 года, а в 2009-м году истребитель получил обозначение JAS39E Gripen.

На вооружение Швеции JAS39E Gripen поступил в 2021 году, заказ составил 60 самолётов, которые должны полностью заменить устаревающие версии C/D. В том же году Бразилия подписала контракт на 36 истребителей Gripen E, часть из которых производится локально с участием бразильской промышленности.

В игру JAS39E был введён в обновлении 2.53 «Огневой контакт». Gripen E продолжает концепцию универсального истребителя, демонстрируя высокие лётные характеристики, эффективность вооружения и лёгкость управления. Главными отличиями от предыдущих модификаций являются новая РЛС Raven ES-05 с АФАР, возможность применения бомб SPICE 250 и дополнительные пилоны под фюзеляжем для ракет AIM-120 AMRAAM. К недостаткам можно отнести относительно невысокую максимальную скорость по сравнению с истребителями 4++ поколения.