История Bf 109 Z началась с усилением бомбардировок Германии Союзниками в 1942 году. Люфтваффе требовался дневной перехватчик с мощным вооружением. Создание Me 210 затягивалось, а модернизации Bf 110 было недостаточно. Тогда инженеры Messerschmitt обратили внимание на He 111 Z — модификацию бомбардировщика, с двумя объединёнными фюзеляжами. Они решили, что могут сделать то же самое с двумя Bf 109. Примерно в 1942 они взяли два самолёта прямо с производственной линии и объединили их, создав Bf 109 Z-0. Он так и не поднялся в небо, потому что был разбомблен Союзниками в 1943 году. Весной 1944 Messerschmitt создали ещё один прототип, объединив два Bf 109 G-6. Они назвали его Bf 109 Z-1, но вскоре проект был заброшен в пользу более перспективных проектов, а Z-1 так и не поднялся в небо.

В игру Bf 109 Z-1 был введён в обновлении 1.79 «Project-X». Это необычный тяжёлый истребитель с мощным вооружением и очень большой максимальной скоростью на больших высотах. С другой стороны, из пушек MK 108 стрелять тяжело, а в манёвренном бою он проиграет большинству одномоторных истребителей.