Вместе с принятием Нидерландами, Германией и другими союзниками по НАТО самолётов F-104 на вооружение, военные Бельгии решили тоже закупить себе подобные самолёты. Так, в начале 1960-х годов Бельгия заказала 100 истребителей F-104G и 12 УТС TF-104G. Причём за 28 из них заплатило американское правительство согласно закону о взаимной военной помощи, остальные же были оплачены бельгийским правительством. Как и в соседних странах, предполагалось строить самолёты силами собственной бельгийской компании, SABCA. Поставки начались уже в апреле 1963 года в первое и в десятое авиакрыло ВВС Бельгии. К 1965 году они заменили все устаревшие F-84. Первое авиакрыло имело более примечательную службу: до самого конца Холодной войны она составляла часть сил быстрого реагирования НАТО, и несколько самолётов всегда находились в 15-минутной готовности к взлёту. А так как они служили недалеко от склада ядерных вооружений в Мяувене (Нид. Meeuwen), то ряд истребителей также имел доступ к ядерным бомбам B-61. На вооружении F-104G простояли до 1982 года, после чего им на замену пришли более совершенные F-16A.

В игру бельгийский F-104G был введён в обновлении 2.37 «Активный поиск» в древо исследования авиации Франции. Самолёт выделяется превосходной динамикой набора скорости, высокой максимальной скоростью и скороподъёмностью, а также мощным курсовым вооружением. Тем не менее, его манёвренность крайне невысока, однако наличие ЛТЦ значительно повышает живучесть самолёта и даёт ему возможность уклоняться от ракет «воздух-воздух».