После огромного успеха Canberra B.Mk.2 дальнейшие модификации машины были лишь вопросом времени. В 1950-х годах компания English Electric построила один прототип Canberra Mk.5, предполагавший установку более мощных реактивных моторов Avon R.A.7 и топливных баков в крыльях. Испытания оказались успешными, и на основе прототипа в 1954 году в серию была запущена Canberra B.Mk.6 с удлинённым фюзеляжем на 30 сантиметров для дополнительных топливных баков. Дальность полёта увеличилась с 4100 км до 5400, а скорость самолёта увеличилась примерно на 16 км/ч. Всего было построено 106 бомбардировщиков модификации.

На её основе конструкторы также разработали версию перехватчика. Так, в самолёт были установлены четыре 20-мм пушки Hispano, два дополнительных крепления для бомб на крыльях и система сброса ядерных бомб с низкой высоты. Данная модель получила обозначение Canberra B(I).Mk.6, и всего было произведено 22 перехватчика. Им на смену быстро пришла версия Canberra B(I).Mk.8, а та, в свою очередь, была снята с вооружения уже к началу 1960-х годов.

В игру Canberra B(I).Mk.6 был введён в обновлении 1.45 «Стальные Генералы». Самолёт получился довольно универсальным: его большая бомбовая нагрузка позволяет применять его в качестве бомбардировщика, а мощное курсовое вооружение и на удивление хорошая манёвренность — в качестве перехватчика. Но за новые пушки пришлось расплатиться потерей максимальной бомбовой нагрузки относительно Canberra B.Mk.2, а большие размеры делают из самолёта лёгкую цель в затянувшемся воздушном бою.