После успеха Ki-45 компания Kawasaki решила сделать ещё более совершенную версию самолёта. Разработка началась в августе 1942 года, и предполагалось создать тяжёлый двухместный двухдвигательный истребитель, но с увеличенными размерами и более мощными моторами. К декабрю проектом заинтересовалось командование Армейской авиации Японии, но тогда они желали одноместный самолёт. Первый прототип, переделанный в одноместный прямо на заводской линии и поэтому с большим остеклением, совершил свой первый полёт в сентябре 1943 года. За ним было построено ещё два самолёта уже с исправленным остеклением. Самолёт был обозначен как Ki-96 и показал отличные лётные характеристики, превосходящие ожидания. Но к тому моменту Армейская авиация вновь заинтересовалась двухместным тяжёлым истребителем, и часть наработок по самолёту будут использованы в создании Ki-102.

В игру Ki-96 был введён в обновлении 1.35. Это крупный двухмоторный тяжёлый истребитель с сильным вооружением, хорошей манёвренностью относительно своих аналогов и отличной скороподъёмностью. С другой стороны, бронирование пилота слабое, Ki-96 быстро теряет энергию, ролл ужасен, а большинство одномоторных истребителей всё ещё будут маневреннее его.